期刊简介

               本刊为专业学术性刊物。主要报道有关人体寄生虫学与寄生虫病的科研成果和防治经验,介绍新理论、新技术和新进展。主要读者对象为寄生虫学与寄生虫病专业的研究、防治、教学人员及医务工作者。                

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  • 杂志名称:中国寄生虫学与寄生虫病杂志
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会,中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
  • 国际刊号:1000-7423
  • 国内刊号:31-1248/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中华预防医学会先进编辑部(97);中华预防医学会优秀期刊一等奖(00);中华预防医学会优秀期刊二等奖(01);中华预防医学会优秀期刊三等奖(01-02)期刊收录:CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 维普收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 文摘与引文数据库, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
中国寄生虫学与寄生虫病杂志2004年第04期

日本血吸虫EST序列的电子延伸及结果分析

刘翰腾;吴忠道;邹赛德;邵筱

关键词:日本血吸虫, 表达的序列标记, 电子序列延伸, 序列分析, 计算生物学
摘要:目的建立日本血吸虫表达序列标签(SjEST)序列自动分析系统,筛选新基因、分析其表达谱.方法建立本地化日本血吸虫专业数据库,整合序列同源性比较软件(BLAST)及片段整合分析软件(PHRAP),运用生物信息学策略编写程序控制EST自动延伸.建立本地化蛋白库,对延伸结果进行蛋白库同源性分析.实现对成批数据大规模自动分析,筛选出可能的新基因全长cDNA序列,并进行基因表达谱分析.结果延伸系统规则有效,延伸结果序列与原始序列高度同源.对552条EST进行自动分析,487条得到不同程度的延长,其中有104条EST原始序列检索无同源性,但经过延伸后获得高度同源性的联配序列信息.根据延伸结果尝试分析基因表达谱,筛选出27个可能新基因.结论建立了本地化的有效的SjEST序列自动分析系统.该系统为新基因的筛选及基因表达谱的分析提供了重要的参考信息.